SMP Diponegoro Majenang yang didirikan atas kekompakan warga Nadliyyin yang dipelopori oleh Almaghfurlah KH. Imam Mahdy (sekarang diteruskan oleh putranya yaitu KH. Hizbullah Huda Al-Mahdy,SH) dan H. Tato Suwarto Pamuji (sekarang Wabup Cilacap) dengan hasil akriditasi “A” di tahun 2007, diusianya yang ke-28 tahun dengan Visi: “ Terdidik, Berkualitas dan Berakhlakul Karimah “ telah banyak berbenah diri di berbagai bidang, kini di tahun 2009 melauncingkan program unggulan baru, yang telah diuji cobakan selama satu tahun, yaitu Madrasah Diniyyah Awwaliyah dan Pondok Pesantren Putri Al-Mahdy.

Ada banyak faktor yang melatar belakangi dilouncingkannya program ini, antara lain :

1. Mayoritas (100%) peserta didiknya adalah beragama Islam.
2. Mayoritas inputnya adalah dari sekolah Dasar (SD) yang belum menyediakan mulok Baca Tulis Qur’an dan Fikih secara berkelanjutan.
3. Minimnya minat peserta didik untuk mendalami kajian agama di musholla/masjid/Madrasah Diniyyah di tempat tinggalnya.
4. Makin santernya arus globalisasi, sehingga begitu lulus SD/MI, anak-anak dihinggapi rasa malu untuk mengaji karena ada kegiatan lain yang kurang bermanfaat bersama teman-teman seusiannya.
5. Hasil musyawaroh Wali peserta didik, Komite dan Yayasan pada awal Tahun Ajaran baru tahun 2008 secara kompak menyetujui.
6. Pihak Qiro’aty koordinator Cilacap wilayah Barat ( Kyai Drs. Mudasir) menyediakan paket khusus Baca Tulis Qur’an bagi tingkat SMP.
7. Pihak Depag Kabupaten Cilacap telah memberikan restu dengan bentuk SK pendirian Madin No.Kd.11.01/5/pp.007/0126/2009.

Jika kita membaca Rindang/No.09/Th.XXXIV/April/2009 Halaman 7, maka sesungguhnya Program Madrasah dan Pondok Pesantren ini adalah sejalan dengan adanya Peraturan Pemerintah (PP) Nomor 55 tahun 2007 tentang pendidikan Agama yang rencananya akan di UN-kan pada Tahun Ajaran 2009/2010 pada jenjang SD,SMP,SMA dan SMK secara Nasional, Sehingga program ini sangat mendukung Peraturan Pemerintah tersebut.

Adapun mengenai tanaga Pengajar dari Madrasah Diniyyah dan Pondok Pesantren Al-Mahdy ini, adalah dari jajaran tenaga Pendidik dan Kependidikan yang ada di SMP Diponegoro Majenang sendiri, dimana sebagian dari tenaga yang ada, adalah alumnus dari beberapa
Madrasah Diniyyah dan Pondok Pesantren yang tersebar di Jawa Tengah, Jawa Barat dan Jawa timur, sehingga kurikulumnya dapat dimodifikasi sendiri, sesuai dengan kebutuhan peserta didik maupun wali peserta didik.
Dengan senantiasa mengharap ridlo dari Allah SWT, segenap Pendidik dan tenaga Kependidikan berjumlah 27 orang, mayoritas swasta, kecuali satu orang DPK hampir pensiun, selalu berusaha mengemban amanat dari masyarakat dan negara demi mewujudkan suksesnya wajib belajar sembilan tahun.